R commander (Rcmdr) - R para seres humanos

R commander (Rcmdr) - R para seres humanos Para los que no lo sepan, el R commander es un paquete del programa de estadística R que le da una interfaz gráfica a algunas de las funciones básicas y más comunes. Para los que no estén acostumbrados al uso del R y deban recurrir a algún manual para conseguir las funciones, les recomiendo que prueben el R commander porque ayuda a ir más rápido y a entender la lógica del funcionamiento del R. ACÁ hay una guía con funciones para complementar al R commander y ACÁ una guía para hacer gráficos. 1. Descripción Así se ve el R commander: En la ventana de arriba se escriben los comandos (si uno elige algo del menú, el comando aparece escrito en esa ventana, lo que ayuda a aprender un poco el uso del R, y además, permite modificar los comandos si tenemos que hacerle algún pequeño ajuste. En la ventana del medio se presentan los comandos en color rojo (una vez que son ejecutados) y los resultados (en azul). En la de abajo van las notas, los avisos y los errores que largue el R. Así se ve el R commander después de hacer un ANOVA (sin escribir nada en la ventana de instrucciones, todo hecho desde el menú): Estos son algunos de los menús: 2. Instalación Para instalar el R commander hay que seguir una serie de pasos 1. Como es un complemento del R, hay que tener instalado el R, para los que no lo tengan y lo quieran probar: 1.a. ACÁ la versión para Windows. 1.b. Las instrucciones para las distintas versiones de Linux están ACÁ * Para los que tengan Ubuntu y derivados, conviene agregar el repositorio del R poniendo en la terminal: deb http:///bin/linux/ubuntu natty/ hay que reemplazar por cualquiera de ESTA LISTA (sin el "http://" ) ; y hay que reemplazar el natty por la versión de Ubuntu que tengan (karmic, lucid, maverick, etc.). Para agregar la llave hay que poner en la terminal: gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821 gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add - y después, para instalar el R: sudo apt-get update sudo apt-get install r-base r-base-dev 2. Entrar al R e instalar el paquete R commander (Rcmdr) y sus dependencias (en Linux es mejor entrar como root, o sea, sudo R). Todo este proceso tarda un siglo!: install.packages("Rcmdr", dependencies=TRUE) 3. Para iniciar el R commander hay que poner en el R: library("Rcmdr") Si quieren que el R commander inicie cuando se entre al R, hay que editar el archivo Rprofile.site (en Linux está en /etc/R) y agregarle esto: local({ old <- getOption("defaultPackages") options(defaultPackages = c(old, "Rcmdr")) }) Otra opción es editar el archivo Renviron.site y agregar esto al final: R_DEFAULT_PACKAGES='Rcmdr' No hagan que el R Commander inicie junto con el R si van a instalar el complemento para calcular diversidad (ver abajo), porque no les va a funcionar, ya que se tiene que cargar primero el complemento y después el R Commander. Para más detalles o por problemas particulares vayan a las fuentes (abajo del todo). Por algunos problemas de dependencias, algunas veces el R o el R commander no se instalan completamente, para solucionar esto, primero hay que entrar al R, después: update.packages() Ahí les va a dar una lista de paquetes para actualizar, le dicen que sí (y) a todos. Va a instalar uno por uno, si son muchos es un lío seguir los errores, por lo que una vez que termine conviene poner update.packages() otra vez. Si vuelven a aparecer paquetes para actualizar es porque a esos les fallan algunas dependencias. Lo mejor es instalar de a uno para no tener problemas y poder seguir los errores. Página oficial del R Información del R commander