Muchas veces la información de una memoria usb o sd (también sus variantes) se pierde, ya que no se percatan que la computadora donde la conectaron estaba infectada de un virus que esconde los archivos como ocultos provocando que los usuarios piensen que están borrados.
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Para recuperar tus archivos, realiza los siguiente pasos:
.1. Conecta el USB.
.2. Abre el menú Inicio.
En Windows 7 y Vista, haz clic a la derecha en Equipo.
En Windows XP, pincha a la derecha en Mi PC.
3. Averigua la letra de unidad que tiene asignado el USB.
Lo normal es que sea F: o G: y que aparezca como disco extraíble.
.4. Entra en la consola de MS-DOS.
Inicio -> Todos los programas -> Accesorios -> Símbolo del sistema.
.5. Indica la letra de unidad del USB. (la que has visto en el paso 3) y pulsa Intro.
.6. Escribe.
attrib -r -s -h *.* /s /d (pulsa Intro de nuevo).
.7. Espera a que aparezca la letra de unidad.
Puede tardar si el USB contiene muchos archivos o carpetas.
.8. Escribe exit y pulsa Intro para salir de MS-DOS.
http://mundoredtotal.com.ve/blog/recuperar-archivos-ocultos-por-virus-en-usb/